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CompetiLab

No. 02合成生物學與 iGEM 競賽

iGEM 國際遺傳工程機器設計競賽

iGEM

如果你曾經好奇,一隻細菌能不能被教會做有用的事,你已經走了一半。好奇心,是唯一的門檻。

用一支團隊真正經歷的方式學合成生物學:一個真實的問題、一套設計出來的生物系統、一個模型、一次實驗,以及向世界解釋它的責任。從第一個想法,走到一支站在 Grand Jamboree 上的隊伍;零件已經準備好,學生的力氣留給科學。

方格與圓形構成的抽象圖,代表培養皿上的菌落。
示意圖
方格與圓形構成的抽象圖,代表實驗桌面的細節。

概述

iGEM(International Genetically Engineered Machine,國際遺傳工程機器設計競賽,也譯作國際基因工程機器設計競賽)是全球規模最大的合成生物學比賽。學生團隊自行選定問題,設計並建造生物系統來回應它,把專案記錄在公開的 wiki 上,並在年度 Grand Jamboree 發表。競賽由獨立的非營利組織 iGEM Foundation 主辦,設有高中組;近幾年,台灣每年都有七到九支高中隊伍參賽。

CompetiLab 的 iGEM 培訓計畫帶台灣的高中生走完這整條路。它是一套合成生物學、團隊研究與科學溝通的教育,依照一個 iGEM 專案會經歷的階段來設計;建模、Human Practices 與文件模組都已經建好,讓隊伍在最初幾週就能開始做科學。要組建或加入正式隊伍的學生,透過 iGEM Foundation 自己的程序報名;我們確保他們準備好出發,並在整個賽季陪在旁邊。

適合誰

  • 對生物、工程、程式或設計好奇的國高中生。不需要實驗室經驗。
  • 想組建或加入高中 iGEM 隊伍,並在賽季開始前就看見整個專案、從問題到 Jamboree 的學生。
  • 被生命系統吸引、想用它們做出真實東西的學生。

學習目標

  1. 01理解合成生物學的核心概念:零件、裝置、系統,以及設計—建造—測試—學習的循環。
  2. 02找出一個真實世界的問題,判斷用生物的方法處理是否合適。
  3. 03設計實驗、批判地閱讀實驗流程,並維持一本別人也能照著做的實驗記錄本。
  4. 04建立簡單的數學模型,用它在實驗前後做決定。
  5. 05實踐 Human Practices:與利害關係人對話,考量安全與倫理,並讓所學改變專案。
  6. 06把專案清楚地記錄並發表給科學家與一般大眾,達到 Jamboree 評審期待的標準。

主題與能力

基礎

  • iGEM 簡介與歷史
  • 合成生物學基礎
  • 生物系統與實驗思維

專案設計

  • 找出真實世界的問題
  • 研究與專案設計
  • 組隊與協作

建造與測試

  • 實驗室安全與基本技術
  • 建模與資料分析
  • 量測與再現性

責任

  • Human Practices
  • 安全、生物保安與倫理
  • 科學溝通

成果

  • 專案文件與 wiki
  • 簡報與競賽準備
  • 團隊故事與精選專案

學習歷程

一個專案,一個階段一個階段走

  1. 01問題

    選一個重要的問題

    從社區或產業的需求出發,和真正面對這個需求的人談,判斷生物學幫不幫得上忙。

  2. 02設計

    設計系統

    把問題翻譯成生物設計:用哪些零件、哪個宿主、成功時應該發生什麼。

  3. 03建模

    上實驗桌之前先建模

    建立簡單的模型預測行為,找出關鍵參數,規劃真正能區分結果的實驗。

  4. 04建造

    建造與測試

    組裝構築體、進行有對照的實驗,把一切記錄在經得起檢視的實驗記錄本裡。

  5. 05對話

    Human Practices

    回到利害關係人身邊,檢視安全與倫理,根據所學修改專案。

  6. 06溝通

    記錄與發表

    為公眾寫下專案、製作簡報,並演練評審會問的問題。

指導與支持

具分子生物、建模、生物資訊與科學溝通背景的導師,在整個賽季與學生團隊並肩工作。涉及濕實驗的部分,在有適當督導、符合機構安全規範的設施中進行。建模範本、wiki 架構與 Human Practices 訪談指南都事先準備好,隊伍的時間用在專案上。

我們教的是過程與標準,並協助隊伍理解 Foundation 對高中隊伍的要求。隊伍報名、資格、安全表單與評審屬於 iGEM Foundation。

方格構成的抽象圖,代表科學儀器。
示意圖

專案方向範例

  • 為在地產業設計的生物感測器

    針對臺灣水產養殖、農業或飲用水中相關污染物的全細胞感測器。

  • 從廢棄物出發的生物製造

    改造微生物把農業副產物轉化為有用的化合物,並附上產量與成本模型。

  • 診斷與偵測

    與臨床或公衛工作者共同設計的無細胞病原或標記偵測系統。

  • 軟體與建模方向

    一個幫助其他隊伍設計、模擬或記錄的工具,建立在使用者研究之上。

AI 與實驗桌相遇的地方

  1. 01

    選殖之前先挑酵素

    用蛋白質結構預測在螢幕上比較候選變體,只選殖最有希望的那幾個。

  2. 02

    預測啟動子的強度

    用已發表的序列—表現量資料訓練一個小模型,替隊伍考慮中的零件排序。

  3. 03

    用手機數菌落

    隊伍自己做的電腦視覺模型,從培養皿照片裡計數並分類菌落。

  4. 04

    把線路擬合到資料上

    讓模型用隊伍自己的量測擬合基因線路的參數,再預測下一個實驗。

  5. 05

    先起草安全論證,再檢查它

    用 AI 助理起草並批評 wiki 的安全章節,揭露使用,每一個主張自己負責。

計畫資訊

時程、形式、費用與申請日期,會在諮詢對談時確認。

常見問題

高中生可以參加 iGEM 嗎?

可以。iGEM Foundation 設有高中組,高中隊伍與大學隊伍在同一個 Grand Jamboree 發表。資格、隊伍要求與費用由 Foundation 訂定且逐年調整;我們的知識專欄整理了歷年規則的要求,最新版本請以 igem.org 為準。

需要實驗室經驗嗎?

不需要。我們從基礎開始,動手操作逐步引入,而且只在有督導的環境中進行。一個強的 iGEM 專案有很大一部分,包括建模、Human Practices 與文件,都在實驗桌以外進行。

CompetiLab 和 iGEM 是什麼關係?

我們是獨立的教育工作室,負責培養與陪伴隊伍。iGEM 由 iGEM Foundation 主辦,負責報名、資格與評審。

一支隊伍需要什麼才能開始?

好奇心、幾位強項不同的學生,以及一位指導老師。其他的我們來協助:問題、設計、建模、利害關係人對話,以及 wiki。

所有常見問題

開始

從一個問題開始。

告訴我們學生念念不忘的是什麼,我們會建議它可以走向哪裡。